alaybourn - 3 months ago 20

R Question

I'm trying to subset a raster based on cell numbers. I want to provide a vector of cell numbers and return a raster with the original cell values for those cells referenced in the cell numbers vector. I tried the

`rasterFromCells()`

`#original raster loaded with 400 sample values ranging from 1:24`

foo <- raster(ncol=20, nrow=20)

foo[] <- sample(seq(1,24),400,replace = TRUE)

#vector of desired cell numbers

my.pts <- c(2,20,200)

#rasterFromCells attempt

bar<-rasterFromCells(foo, my.pts, values=TRUE)

How can I return a raster layer with

`foo`

`NA`

Answer

If you want to create a new raster with the values at only the cell locations in `my.pts`

replaced by the values at those cell locations in `foo`

and all other cell values set to `NA`

, you just have to:

- create a raster (i.e.,
`bar`

) the same size as`foo`

. - fill it with
`NA`

s - Use
`bar[my.pts] <- foo[my.pts]`

For example:

```
library(raster)
set.seed(123) ## for reproducible results
foo <- raster(ncols=20, nrows=20)
foo[] <- sample(seq(1,24),400,replace = TRUE)
#vector of desired cell numbers
my.pts <- c(2,20,200)
## create raster the same size as foo filled with NAs
bar <- raster(ncols=ncol(foo), nrows=nrow(foo))
bar[] <- NA
## replace the values with those in foo
bar[my.pts] <- foo[my.pts]
foo[my.pts]
##[1] 19 23 14
bar[]
## [1] NA 19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
## [32] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
## [63] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
## [94] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
##[125] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
##[156] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
##[187] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
##[218] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
##[249] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
##[280] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
##[311] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
##[342] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
##[373] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
```

Another approach to accomplish the same result is to copy `foo`

to `bar`

and then set all cells locations not in `my.pts`

to `NA`

s:

```
bar <- foo
bar[setdiff(1:ncell(foo),my.pts)] <- NA
```